江充等人限制，无法向武帝辩明情况，情急之下又无上策，便听从少傅石德之计。
于七月壬午日，将江充缉拿，并斩杀韩说。而协助江充办理此案的御史章赣逃出，去往甘泉行宫见武帝。
尽管后宫经历查蛊一事人心惶惶，宫外又情势紧急，卫皇后依旧有条不紊地维持着宫禁秩序。
因太子能指挥到的车马有限，刘据希望得到母亲的支持，在决定起兵后连夜派舍人求见皇后时，仍需持符节进入长秋门，通过长御倚华呈报皇后。
尽管事态进退两难，但已经历公孙家族灭、二位公主坐诛的卫子夫并未妇人之仁、任人宰割。
卫皇后果断行使皇后的权利，调动中厩皇后的马车装载射手，搬取武库的兵器，调发长乐宫的卫队以助太子。
太子向文武百官宣称江充造反，斩杀江充巡示朝野，并在上林苑烧死了一众胡人巫师。
刘据起兵后，武帝认为太子一定是受到了江充等人的陷害才这样做。
便派遣使者入长安探查。使者却因胆怯未敢入城，对武帝谎称太子造反要杀自己。
武帝由是大怒，派左丞相刘屈氂发兵讨逆。面对刘屈氂手中这道不知真假的皇帝玺书，太子宣称武帝在甘泉宫病重，发兵是怀疑京城有变，奸臣想作乱。
武帝在这时从甘泉宫回长安，驾临长安城西建章宫，下诏征发三辅附近郡县之兵，及二千石以下官吏皆归刘屈氂统领。
刘据因此无法调遣三辅军队，便派遣使者假传诏令赦免长安城中诸官府中的囚徒，征发看守武库的军队，并派使者如侯持符节去调动长安附近长水和宣曲两地的胡人骑兵，命令他们全副武装之后前来长安会合以充军。然而武帝派遣的使者侍郎莽通赶到，告知长水校尉太子的符节是假的，并斩杀如侯亲自引长水宣曲胡骑入长安。
武帝又征发船兵，一并交由大鸿胪商丘成。而后，护北军使者任安虽接太子发兵符节却作壁上观。
太子刘据屡次调兵失败，故所率兵卒与刘屈氂的官兵数量差距越来越大。太子领兵离开北军，驱使长安四市的百姓共有几万人。来到长乐宫西阙下面时，碰上了刘屈氂的军队，混战五日后，血流入渠，死者数万。
长安城中扰乱，传言太子造反，因此民众不再归附太子，归附刘屈氂军队的逐渐增多。太子不敌，战败出奔。
七月庚寅日，太子得丞相司直田仁之助，于覆盎门逃出长安，隐匿于湖县。