对59例egfr突变的晚期nsclc患者的肿瘤活检标本进行了检测，这些患者以前在1g2gtki上经历过pd。在38例63%患者中检测到egfrt790m。1g2g-75.8个月，t790m?组和t790m+，1.64;95%ci，0.95-2.83;p0.07;补充图s5。在t790m+和t790m?组之间，之前接受治疗的情况没有差异，包括作为最后线治疗的egfrtki65.8%vs.61.9%，p0.76、以前使用过化疗76%vs.66%，p0.75，wilcoxon检验，或化疗暴露的持续时间平均215天vs.175天，p0.75。与以前的报告一致，显微镜下的组织学转化是罕见的，一例鳞状转化a450和另一例混合腺癌小细胞组织学a092在基线和耐药后都观察到了。
t790m+和t790m?疾病状态的基因组图谱
我们首先评估了我们队列中的体细胞基因组改变(除egfrt790m外)与38例晚期egfr突变非小细胞肺癌患者的治疗初期队列(wes数据)的患病率差异。tp53snv改变在tki耐药人群(63%)中比治疗初期人群(45%)更为普遍。此外，我们检测到与治疗初期肿瘤相比，治疗耐药肿瘤中tert和编码于14q22的三个基因(ptgdr、sav1和sos2)的基因组扩增率总体较低。接下来，通过比较t790m+和t790m?，我们试图确定先前报道的并确定潜在的新的治疗可处理耐药机制?抗tki的样品。5例(8%)患者出现met改变，主要发生在t790m?患者队列。在一名患者(a056)中，检测到导致met外显子14跳跃(metex14)的剪接位点缺失，外显子14处的转录缺失通过rnaseq数据验证。该患者还表现出染色体臂7p缺失(egfr突变缺失)和12q扩增(包含mdm2和cdk4，通常用metex14扩增)。同样，我们没有在另一名t790m?患者中检测到原发性外显子19缺失l858r突变(a058)，表明失去激活egfr突变是获得性耐药真正罕见的机制。pik3ca突变(n10，17%)和her2扩增(n4，7%)是常见的，但基于t790m状态没有差异，尽管耐药肿瘤中pik3ca改变的频率(17%)总体上高于晚期治疗未经egfr突变肿瘤的患者(5%，p0.09)。在pik3ca突变中，值得注意的是，大多数是克隆的(n57)，并且由c